日本人個子矮是有歷史的，古時候就矮，所以中國人稱呼日本國為「倭國」。子啊古代日本，身高160厘米，就算高個子了。日本人之所以矮，就是基因的問題。據人類學家考證，在日本列島上，本土土著居民是最早一批走出非洲大陸的小黑人，這種人在日本、台灣、東南亞都有分布。當第二批人類走出非洲後，與小黑人相遇，後人勢力比較強的，例如大陸地區，小黑人就被消滅了。而在日本，由於交通閉塞，與外部交流不多，後人的勢力並不強，所以和小黑人通婚後血統混合，導致後人身高都不高。抗日戰爭時期，儘管日本入侵了中國，但是，從當時日本鬼子的身高來看，距離中國人，有相當一段距離。

到了戰後，特別是在上世紀50年代，日本在美國扶植下，開始了經濟騰飛，日本開始給下一代拚命的補充牛奶。導致日本身高才增長起來。也正因為如此，日本人平均身高在8、90年代超過中國了，這讓日本人高興不已。

但是，好景不長，現在，中國經過了發展，對於兒童營養的重視，平均身高又反超了日本，更加讓日本人擔心的是，日本從明治時期開始進行」學校保健統計調查「。據保留的大量數據顯示，日本17歲年輕人身高已經接近成年人，本來這個年齡段是長得最快的，但他們卻幾乎停止長高。

日本兒童家庭綜合研究所所長衛藤隆研究表明，近30年來，日本男性的平均身高沒有顯著變化，衛藤預測，未來，日本年輕男性的將會變得越來越矮小，原因是在最近的調查中發現，日本男性「短足化」也就是腿越來越短的現象不斷加劇，這就顯示，日本的男性的身高在下降趨勢。

這也證明，後天增加營養帶來的身高增長畢竟不能持久，先天的基因力量更為強大。

由於日本是單一民族，基本上都是族內通婚，這就造成了無法得到外來的優秀基因，導致本民族的基因越來越退化。在這種理論下，有一種說法是50年代美國軍隊占領日本，出現很多混血，那一時期日本基因與外來基因發生了融合，致使日本身高增高。

而像中國幅員遼闊的國家，南北、東西差異明顯，國家內不同地區的基因互相融合，使得人種基因持續優化，這一點是日本小島無法超越的。

也正因為這樣，日本學者擔心為未來日本會成為侏儒國家，而提出建議，修正日本國策，變日本為移民開放國家，以吸收外來基因。

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