吳奇隆入行多年，感情生活多姿多采，過去戀情大多數都與合作拍檔擦出愛火花，其中他在2006年與中國女星馬雅舒結婚，不過婚姻只維持三年。 徐若瑄 1988年當時是少女隊成員的徐若瑄，與小虎隊的吳奇隆屬同一間唱片公司，因近水樓台關係因而傳緋聞，不過戀情只是維持兩年告終。
楊采妮 吳奇隆與楊采妮在1994年因合作電影《梁祝》而傳出緋聞，雖然兩人沒有作出澄清，不過《梁》導演透露當時拍攝期間，兩人經常以一起的姿態出現
蔡少芬 蔡少芬與吳奇隆在1999年先後因合拍劇集《創世紀》及電影《還我情心》時戲假情真，兩人宣布戀情後,不時以情侶檔姿態四出賺錢！不過最終因性格不合為理由，拍拖三年便分手
馬雅舒 吳奇隆與中國女星馬雅舒在2001因合拍劇集《蕭十一郎》時在一起，並在2006年在昆明註冊結婚，不過婚姻只維持了三年，有指二人離婚原因是女方劈腿。兩人離婚翌年，馬雅舒即與澳洲籍老公James結婚，2014年更為對方誕下兒子。