活佛轉世是藏傳佛教高僧法位繼承特有的方式。目前，藏傳佛教最大的幾個活佛轉世系統名號都經歷代中央政府冊封，如達賴轉世系統、班禪轉世系統等。中央政府既然有冊封的權力，自然也有褫奪封號或禁止轉世的權力。歷史上，曾有三個最著名的活佛被「褫奪封號」事件。
拉薩瑪吉阿米餐廳，傳說六世達賴與情人私會的地方。
六世達賴倉央嘉措：放蕩不羈廢黜稱號
這位被人稱作「情歌王子」的六世達賴喇嘛出生於康熙二十二年。五世達賴圓寂後，其弟子秘不發喪，在隱瞞康熙帝的情況下，秘密尋訪轉世靈童。倉央嘉措由此開始了他極具才華但卻悲情的一生。通常轉世靈童在五、六歲時，已經持戒受教，過起晨鐘暮鼓的生活。而倉央嘉措卻是14歲時才被認定的活佛。正值「青春叛逆期」的他，較於其他「莊嚴法相」的活佛，生活習慣過於無拘無束。傳說，他經常流連於市井，終日與歌女為伴。今日拉薩城中還有一處叫做「瑪吉阿米」的餐廳。傳說，六世達賴就在這裡與他的情人「瑪吉阿米」私會。最終，六世達賴被當時手握西藏地方權力的拉藏汗以「不守清規戒律」告發。拉藏汗上奏中央政府，稱倉央嘉措的尋訪與認定未經中央批准，是假活佛，請予「廢立」。康熙帝准奏，廢黜達賴，並派遣軍隊親自護送七世達賴轉世靈童至拉薩，責成皇十四子大將軍王欽賜金冊金印。最終，在清廷欽差主持下，七世達賴於布達拉宮坐床繼位。
十一世班禪在北京西黃寺為六世班禪衣冠冢敬獻哈達。
紅帽系夏格巴活佛：挫骨揚灰禁止轉世
說起這位活佛的故事，遠比褫奪六世達賴封號還要「驚心動魄」。倉央嘉措只不過被康熙皇帝廢除了封號，但達賴系統仍被允許轉世。而這位紅帽系的夏格巴活佛，直接就被乾隆爺以「叛國罪」禁止轉世。「夏格巴」是噶瑪噶舉派活佛轉世系統一支。十世夏格巴活佛是六世班禪的兄弟。當時，班禪的駐錫地日喀則地區並不太平。來自今尼泊爾境內的廓爾喀部落日漸強大，其軍隊三不五時侵擾日喀則地區。此時，正好乾隆爺七十大壽，六世班禪就想著借「祝壽」之際，來北京躲躲清凈。
乾隆爺也頗具「統戰」頭腦，為了邊疆穩定對班禪極為禮遇。他不僅在北京為班禪修建了行宮（今北京西黃寺），還在承德避暑山莊仿照班禪駐錫地日喀則的扎什倫布寺修建了一座行宮。得到乾隆如此款待，班禪自然有種「賓至如歸」的感覺。班禪本想在賀壽完多住些時日，誰承想突然染上「天花」，不幸在京城圓寂。乾隆為表達對班禪的體恤，賜給供養班禪的寺院扎什倫布寺一筆豐厚獎賞。不料，正是這筆封賞，引發了一場「血案」。
紅帽系十世夏格巴活佛因不滿得到六世班禪的「遺產份額」，公然勾結廓爾喀軍隊將扎什倫布寺打劫一空。這種「叛國」行為，觸及了清朝皇帝底線。乾隆遂派福康安大將軍前去平叛，十世夏格巴最終選擇自盡。但這仍不能消除皇帝的怒氣，乾隆下令「將其屍骨掛於西藏及康區各大寺院」以示警告。隨後，夏格巴所屬寺院、土地全部被查抄，此轉世系統也被清廷勒令禁止轉世，其僧人一律改信格魯派。
布達拉宮內，十三世達賴跪拜慈禧太后壁畫。
十三世達賴：廢后復立迷途知返
十三世達賴的一生簡直可以用「跌宕起伏」來形容。1904年，英軍入侵西藏。十三世達賴被迫出走蒙古。他本意是取道蒙古，進京面見光緒帝。但由於他與當時的駐藏大臣矛盾重重，於是被駐藏大臣誣告「勾結俄國」。清廷因此 「褫革」了其達賴封號。當清政府查明達賴仍「心屬中央」後，決定召其「上京面聖」。皇帝以君臣之禮接受了達賴拜見後，於1906為其恢復尊號。十三世達賴一心想抵禦外國侵略勢力，希望中央政府能助其抗英。但此時自身難保的清政府對侵略者軟弱的態度，令達賴喇嘛十分失望。加之受外國勢力的「威逼利誘」，使得十三世達賴開始偏離「維護祖國統一」的道路。他選擇了第二次出走，此次目的地是印度。清廷對於達賴出走印度、勾結英國的行為十分震怒。1910年，清政府再度革除達賴尊號，並下令停止轉世。
此後，經歷了朝代更替，中央王朝也不復存在。但中國人統一的願望一直在延續。1919年，北洋政府開始與達賴接觸，並表示相信達賴「親英非出本心」。達賴此時也表現出悔意。最終，十三世達賴於1928年，派代表到國民政府所在地南京向中央政府陳述西藏地方政府願意擁護中央政府。1931年，西藏在南京正式成立了「駐京辦」。十三世達賴喇嘛，在生命的最後終於回歸到了擁護「祖國統一」的正軌，使得達賴轉世系統得以繼續傳承。