中職長年實施上、下半季賽制，為了符合世界潮流，本季首度採行單一球季制，味全龍隊年度戰績排名第三挺進季後賽，首輪2勝1敗淘汰統一獅隊，總冠軍賽4勝3敗扳倒年度排名第一的興農牛隊，完成2連霸，隊史累積3冠追平兄弟象、統一獅，3隊並列史上最多。
中職自成一格，堅持上、下半季的用意是擔心單一球季上路後，一旦球隊之間勝差太大，聯盟票房會崩盤，兩個半季可製造兩波高潮，增加對球迷的吸引力；各隊經過多年討論，回應輿論、球迷的聲音，本季決定採行新制試水溫。
時報鷹隊前一季因放水事件主動停權，中職隊數被迫從7隊縮成6隊，新球季開打前，兄弟象隊領隊洪瑞河帶著沈痛、無奈的心情喊話，如果發現隊上有人涉賭，不惜解散球隊向社會大眾負責，希望球員不要「不見棺材不掉淚」。
中職各隊出賽場次增至105場，寫下單季新高，聯盟整季315場球季賽69萬人次觀戰，單場平均2191人雖比前一季成長7%，但和前七年（單季至少5千人）相較，還是差了一大截，球迷對於中職的乾淨度仍有疑慮。
牛隊洋砲怪力男震撼中職，整季出賽104場，打擊率3成87、全壘打31支、打點101分，成為史上首位打擊三冠王，三項成績全是中職開打九年最佳紀錄（全壘打追平1996年鷹俠），安打137支也排名第一。
年度頒獎典禮上，怪力男除了這4座個人獎領到75萬元獎金，年度MVP再領20萬，另獲年度最多單場MVP獎、最佳九人一壘手獎，破紀錄7個獎項合計110萬，若再加上球團頒發的比賽獎金，整季賺進200萬上下，笑說「可回美國風光結婚，希望不要被扣太多稅」。
牛隊洋砲怪力男震撼中職，成為史上首位打擊三冠王，不過季後賽遭到對手破解，只在中職打一季，隔年未獲續約。 聯合報系資料照
牛隊洋投力拔山也有驚人之舉，來台初登板就投出無安糽比賽，3月1日在台中球場對象隊之戰以2：0獲勝，繼1991年龍隊陽介仁、92年象隊尼洛、97年牛隊楓康之後，成為中職史上第四人。
興農牛洋投力拔山台初登板就投出無安糽比賽。 聯合報系資料照
本季賽事結束後，曼谷亞運模棒球賽12月登場，史上首次開放職棒球員參賽，中華隊22名球員有10人來自中職，包括兩名投手劉義傳、吳俊良，8名野手曾智偵、吳昭輝、王光輝、黃忠義、張泰山、林琨瀚、黃煚隆、闕壯鎮，台灣大聯盟唯一代表是許銘傑。
台灣棒界首支「夢幻隊」出征國際賽，而且打鋁棒，亞運前兩輪分組循環預賽對南韓兩敗、對日本1勝1敗，到了四強賽再輸日本，失去爭金資格，最後只贏大陸奪下銅牌。.
台灣棒界首支「夢幻隊」出征國際賽。 聯合報系資料照
日本隊以社會人、大學球員為主，對中華隊3戰2勝，台灣職棒球員的表現讓不少球迷抓狂，有人嗆聲要他們捐出亞運銅牌獎金100萬元，一度成為熱門話題。
中職九年大事紀
2月19日，「明華園」當家小生孫翠鳳在開幕戰表演節目中，從兩層樓高的竹梯頂端摔下，造成腳骨膜破裂，這場比賽後來因雨延賽。
2月21日，中職開打9年首度採行單一球季制，統一獅隊在新球季首戰7：4擊敗味全龍隊，台北球場只有3173人進場，寫下歷年開幕戰觀眾最少紀錄。
2月24日，中職會長陳重光病逝兩天後，聯盟部分常務理事達成共識，推派興農牛隊總裁楊天發代理會長職務，任期直到新會長產生。
3月4日，臨時常務理事會責成聯盟規畫、籌設淨安小組，全力杜絕賭博歪風，小組成員邀請社會公正人士、情治單位人員參與。
3月14日，兄弟象、和信鯨之戰4局下，李居明揮出隊史第7千支安打，象隊成為史上首支安打數突破7千大關的球隊。
李居明揮出兄弟象隊史第7千支安打。 聯合報系資料照
5月30日，味全公司易手，頂新國際集團總部副董事長魏應行成為味全新任董事長，公開表示龍隊將會繼續運作，也不會改名。
7月22日，中華奧會主席黃大洲獲選中職棒第三任會長，任期到1999年底。
8月22日，和信鯨隊42歲投手郭源治擊敗味全龍隊，締造個人生涯最佳11連勝紀錄，連續111天未嘗敗績。
9月21日，中職會長黃大洲呼籲政府早日發行「公辦職棒彩券」，透過公開透明化的制度，消弭職棒隱藏性危機，導正賭博歪風，讓中職起死回生。
10月25日，興農牛隊在台中球場4：3擊敗三商虎隊，奪下隊史首座季冠軍。
11月11日，味全龍隊在台中球場5：2擊敗興農牛隊，完成2連霸，也是徐生明領軍第二次封王。
12月4日，前三商虎隊洋將鷹俠轉戰台灣大聯盟兩個球季，確定遭到年代勇士隊釋出，結束台灣職棒9年生涯。
12月24日，統一獅隊曾智偵確定出任獅隊總教練，成為隊史第四任教頭（不含代理人選）。