台北市長柯文哲透過媒體人安排會見前總統李登輝，李登輝總統利用機會當面詮釋兩岸關係為「特殊國與國關係」，並指示在場幕僚王燕軍從台灣地緣政治、戰略思考角度，應與中國發展出「特殊國與國關係」的基本論述及必要性，向柯文哲及隨行拜會人士做了詳細說明；消息尚未傳至台灣媒體，北京國台辦方面就已得知內情，並傳出大怒要求柯文哲說明，柯文哲也立即於昨（12）日加碼強調「兩岸一家親」，向中共表白心跡；針對此一轉折，李登輝總統辦公室主任王燕軍接受《放言》訪問時表示，北京當局的怒氣沒有必要，李總統是從大局剖析兩岸關係發展的必然趨勢。
王燕軍證實，李柯會面當日，李總統指示王燕軍向來訪的柯文哲等人闡述李總統向來提倡的兩岸應朝向「特殊國與國關係」發展的主張，北京因此生氣實在不必要；李總統尊重各種不同立場，無意強求任何人接受。
王燕軍說，李總統所說的「特殊國與國關係」，強調「特殊」，與「兩國論」不同。
外傳李總統對著柯文哲一行批評蔡英文總統「無能」；王燕軍澄清，李總統說的是不明白蔡總統改革那麼多的目標及動機，沒有聽蔡總統說明，覺得不了解；感嘆蔡總統身邊缺乏人才，絕沒惡意批判之意，「無能」兩字更是空穴來風，並非事實。
王燕軍也強調，李前總統沒有「鼓勵」柯文哲選總統，而是在見面初始寒喧時，談到柯文哲市長選舉民調領先，選戰沒有什麼問題之際，隨口問了一句「聽說你要選總統？」柯文哲當即否認回說「沒有沒有」。就結束了這個話題。
關於「兩岸一家親」之說，王燕軍回憶，現場，李總統沒有特別觸及，僅是要柯文哲尊重議會議員質詢不同意見，不要隨便亂講話，此時，同行的媒體人老包插嘴說：「對對，不要再講兩岸一家親」，李總統並未評論。
平素會客都衣衫齊整，注重禮儀的李總統，和柯文哲等人拍的照片，顯示李總統穿的是睡衣，引發李總統未著正式服裝是否有其他意涵的討論；王燕軍主任解釋，外界多疑了，李總統年事已高，穿脫衣物不方便，近來居家見客，大都著睡衣睡袍，前一陣子和蘇貞昌前院長聊天，也是這樣穿著。