就在蔡碧仲回應媒體，拔管案的一切都是可受公評之事，自己也確實有參與2次跨部會小組會議，但他表示自己只是代表法務部參與，提供專業法律意見並提供有關管中閔的一些事實。另外他也針對管中閔的獨董身分提出看法，國人對於法律或學校規定等一般命令，有沒有嚴守規定、守不守法是一回事，至於有些社會現象似乎把違法事情認為是瑕疵，那是種判斷並強調「但不能把違法的事情，把它拿來泛政治化，這是不對的。」
對於蔡碧仲的說法網友紛紛痛批「大學自治無罪 還在違法」、「有沒有違法也不代表能拔人當選校長 你們有送教評會嗎」、「哪裡違法又說不出來...又不敢全操」、「法務部認定阿扁符合保外條件，才是最大的違法」、「專業的恐怕不是法律，是拍馬逢迎......」。
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