1、為何人用光了查克拉就會死
根據斑的解說，人本來是沒有查克拉的，人的查克拉來源於神樹/十尾，那麼人為什麼用光了查克拉後就會死呢？這不得不讓人想起了人柱人，人柱力被抽走了尾獸之後就會死，這麼說每個忍者都等同於人柱力？
2、三代真的是最強火影嗎
一直以來爭論不休的話題之一，三代火影乃歷代最強，這句話是伊魯卡說的。伊魯卡在16年前九尾襲擊木葉的時候還是小孩子，以他的年齡撐死只認識三代和四代而已，根本沒見識過初代二代，就連四代的實力和三代全盛實力可能都不知道，所以他根本沒資格判定。就目前而言，最強火影明顯是初代。
年輕的三代到底有多強？大野木不也是很老了嗎？就算穢土的三代是年輕的估計也強不了多少。不管怎麼看，全盛時期的三代頂多也就是強於綱手，最多持平於二代和生前四代而已，絕對不可能比初代強。
PS：」最強「在日語中並不是獨一無二的意思，這有點像數學裡的最值與極值一樣，所以其實很多日漫里的」最強「，實際上正確來說應該翻譯成」極強「更正確，但是普遍被翻譯成」最強「，所以日漫里才會動不動就最強攻擊、最強防禦什麼。
3、鼬的年齡與身高
鼬滅族的時候只有13歲啊，可是身高卻差不多一副大人模樣，與第一部12歲的佐助對比，相差甚遠，這實在不科學。
4、萬花筒的移植
假如說兄弟二人分別交換彼此的萬花筒寫輪眼，那豈不是彼此都能得到永恆萬花筒寫輪眼嗎？這實在太BUG了。
5、四代火影的八卦封印和屍鬼封盡
鳴媽將死，四代要把鳴媽剩餘的查克拉封印在鳴人身上，讓鳴媽能見到長大後的鳴人，此時無關九尾。而九尾要另外封印，用屍鬼封盡。但是接下來卻說屍鬼封盡無法將九尾的全部查克拉封印，只能封印一半。
那麼既然沒辦法全部封印了那為什麼不幹脆把九尾全部封印在鳴人身上呢？這樣自己也不用死，鳴人以後的生活也有人照顧，不得過著痛苦孤獨的生活。無論是看幾遍，最後只能歸結於四個字：劇情需要。