火影忍者世界中，幾乎每個忍村都有自己的特殊暗殺機構，這些統稱為暗部，在所有忍村的暗部中，木葉的暗部應可以稱得上是最強了，但是隨著劇情的發展，木葉村又神奇的出現了另一個組織，那就是根，那麼根和暗部到底有什麼區別呢？今天給大家簡單介紹下！
首先，建制不同，根是暗部的培訓部門，雖然不由暗部隊長指揮，但是從建制上來說，是有著包含關係的，也就是說，根雖然有自己的組織名稱，但是其實還是屬於暗部。
其次，成員不同，暗部成員由村中的精英忍者擔任，暗部可以邀請忍者加入其中，成員也可以申請離開，而根則不同，根的成員多來源於孤兒，在孤兒中挑選十分有忍者天賦的兒童進行培養，完全忠於組織，所有成員都被下有咒印。
再次，首腦不同，暗部成員由火影直接支配，根雖然也隸屬於木葉，但僅聽從顧問團藏的命令，屬於團藏的私有力量。
最後，雖然暗部成員都是精英忍者，曾經有很多強大的忍者加入，但是從平均實力來講，根的實力更加強悍，也更加的無情。