最近，就印尼軍方在五十年之前的屠殺行為，一次從所未有的公開的研究討論會議在印尼展開。在一九六五年到一九六六年短短一年內，印尼軍方通過各種手段暴力屠殺了印尼內部數十萬親共人員。大多數人都認為共有約五十萬的人被清洗，其中華人就占了一半之多。這一次的研討會是由非政府的組織舉辦的，也獲得了印尼官方的認可和民間的大力支持。那麼這樣的屠殺慘案究竟是如何發生的，為什麼數十萬的華人都這樣被屠殺了呢？
大屠殺的導火索是共和方和陸軍方面存在時間頗久的矛盾。當時的總統並不喜歡真正的民主，他希望搞得其實是一個人的絕對權力。所以他希望得到軍方的支持，表面上十分支持軍方，暗地裡又培養印尼共，以達到雙方互相牽制的作用。在一九五一年初七，印尼共的黨員還沒突破五位數，而到了一九六五年的時候，印尼共已經有了超過二百八十萬的黨員，也成為了當時印尼擁有最多人員的黨派。印尼共也成為了世界上除去蘇聯和中國外最大的共產黨，這麼快速的發展是讓印尼軍方沒有想到的。而印尼軍方的實力也在不斷增長，在認識到當時總統的野心後，他們的關係也在不斷惡化中。但是總統一手牽制著雙方，矛盾以深卻也沒有爆發。這樣的情況到了一九六五年的時候就不能維持了，總統患病而且病情不斷惡化，雙方矛盾已經處於臨界點。印尼共在這次博弈中充當了先發制人的角色，「九卅事件」隨即產生，印尼共策劃政變，一夜之間六位陸軍高級軍官就遭到殺害。陸軍自然不會坐以待斃，這一次反撲就釀成了數十萬華人被屠殺的悲劇。
軍政府知道印尼共的勢力強大，只有集結全國勢力才可以給它沉痛打擊。這就是為什麼他要宣傳是中國參與了這一次政變，只有對抗外敵之時才能使各方勢力都能團結起來。毫無疑問，這樣的渲染也是很成功的，反華情緒一度高漲。在那之後，就是對於暴行的煽動了，反華情緒之下，華人的安全岌岌可危。雖然沒有證據證明中國參與了這一次政變，但是共和組織的地位已經受到打擊，軍政府的反撲加上反華情緒的不斷煽動高漲，一九六五年短短一年之內，數十萬華人被殺害。